MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 109952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009525	CGG	2	6	186319	186324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659920
4502	NC_009525	ACCG	2	8	186335	186342	25 %	0 %	25 %	50 %	148659920
4503	NC_009525	AAG	2	6	186365	186370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659920
4504	NC_009525	GCCA	2	8	186379	186386	25 %	0 %	25 %	50 %	148659920
4505	NC_009525	CGA	2	6	186397	186402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659920
4506	NC_009525	CAT	2	6	186444	186449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659921
4507	NC_009525	CGC	2	6	186522	186527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659921
4508	NC_009525	GGC	2	6	186549	186554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659921
4509	NC_009525	AC	3	6	186573	186578	50 %	0 %	0 %	50 %	148659921
4510	NC_009525	ATC	2	6	186595	186600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659921
4511	NC_009525	TGG	3	9	186608	186616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659921
4512	NC_009525	GCC	2	6	186633	186638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659921
4513	NC_009525	TGG	2	6	186674	186679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659921
4514	NC_009525	TTC	2	6	186682	186687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659921
4515	NC_009525	GGA	2	6	186700	186705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659921
4516	NC_009525	ACC	2	6	186742	186747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659921
4517	NC_009525	GTG	2	6	186793	186798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659921
4518	NC_009525	CGC	2	6	186810	186815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659921
4519	NC_009525	ATC	2	6	186817	186822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659921
4520	NC_009525	TCG	2	6	186848	186853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4521	NC_009525	ATC	2	6	186874	186879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659921
4522	NC_009525	GGC	2	6	186884	186889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659921
4523	NC_009525	GCA	2	6	186909	186914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4524	NC_009525	TGC	2	6	186929	186934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4525	NC_009525	TGGCCG	3	18	186935	186952	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148659921
4526	NC_009525	CCG	3	9	186950	186958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659921
4527	NC_009525	TGG	2	6	187006	187011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659921
4528	NC_009525	CGC	2	6	187029	187034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659921
4529	NC_009525	TGG	2	6	187052	187057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659921
4530	NC_009525	GGT	2	6	187086	187091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659921
4531	NC_009525	CGG	3	9	187130	187138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659921
4532	NC_009525	AAC	2	6	187150	187155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659921
4533	NC_009525	GAT	2	6	187161	187166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659921
4534	NC_009525	TCG	2	6	187181	187186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4535	NC_009525	TCG	2	6	187250	187255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4536	NC_009525	CGG	4	12	187266	187277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659921
4537	NC_009525	GGC	3	9	187291	187299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659921
4538	NC_009525	GAC	2	6	187300	187305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659921
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4540	NC_009525	GTG	2	6	187372	187377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659921
4541	NC_009525	GCA	2	6	187407	187412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4542	NC_009525	GGA	2	6	187440	187445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659921
4543	NC_009525	GCCG	2	8	187483	187490	0 %	0 %	50 %	50 %	148659921
4544	NC_009525	TGC	2	6	187511	187516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4545	NC_009525	GGCCGA	2	12	187518	187529	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148659921
4546	NC_009525	ACG	2	6	187538	187543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4547	NC_009525	GAC	2	6	187558	187563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4548	NC_009525	ACG	2	6	187568	187573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4549	NC_009525	ACG	2	6	187613	187618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659921
4550	NC_009525	CGG	2	6	187628	187633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659921
4551	NC_009525	CAC	2	6	187770	187775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659921
4552	NC_009525	TGT	2	6	187778	187783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659921
4553	NC_009525	GAA	2	6	187794	187799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659921
4554	NC_009525	GC	3	6	187839	187844	0 %	0 %	50 %	50 %	148659921
4555	NC_009525	CGG	3	9	187873	187881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_009525	GAA	3	9	187930	187938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_009525	TCG	2	6	187946	187951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_009525	CGT	2	6	187956	187961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_009525	CGC	2	6	188054	188059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_009525	AAC	2	6	188073	188078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_009525	TTGA	2	8	188082	188089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_009525	CGA	2	6	188127	188132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_009525	GCC	2	6	188176	188181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659922
4564	NC_009525	GAG	2	6	188184	188189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659922
4565	NC_009525	GCTG	2	8	188192	188199	0 %	25 %	50 %	25 %	148659922
4566	NC_009525	CCA	2	6	188203	188208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659922
4567	NC_009525	GC	3	6	188220	188225	0 %	0 %	50 %	50 %	148659922
4568	NC_009525	GAC	2	6	188247	188252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659922
4569	NC_009525	CAA	2	6	188273	188278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659922
4570	NC_009525	ACT	2	6	188293	188298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659922
4571	NC_009525	GGC	2	6	188339	188344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659922
4572	NC_009525	GCC	2	6	188358	188363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659922
4573	NC_009525	ACG	2	6	188368	188373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659922
4574	NC_009525	GCT	2	6	188420	188425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659922
4575	NC_009525	GCC	2	6	188454	188459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659922
4576	NC_009525	AGC	2	6	188473	188478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659922
4577	NC_009525	AGC	2	6	188533	188538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659922
4578	NC_009525	GCG	2	6	188584	188589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659922
4579	NC_009525	TGG	2	6	188614	188619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659922
4580	NC_009525	GCTG	2	8	188656	188663	0 %	25 %	50 %	25 %	148659922
4581	NC_009525	CGG	2	6	188698	188703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659922
4582	NC_009525	CTG	2	6	188718	188723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659922
4583	NC_009525	CGA	2	6	188738	188743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659922
4584	NC_009525	GGAA	2	8	188776	188783	50 %	0 %	50 %	0 %	148659922
4585	NC_009525	AATC	2	8	188808	188815	50 %	25 %	0 %	25 %	148659923
4586	NC_009525	GATACG	2	12	188909	188920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148659923
4587	NC_009525	GGC	2	6	188964	188969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659923
4588	NC_009525	GGGT	2	8	189047	189054	0 %	25 %	75 %	0 %	148659923
4589	NC_009525	CGTAGC	2	12	189062	189073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148659923
4590	NC_009525	GTA	2	6	189192	189197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659923
4591	NC_009525	ACGGC	2	10	189233	189242	20 %	0 %	40 %	40 %	148659923
4592	NC_009525	CGT	2	6	189356	189361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659923
4593	NC_009525	CGC	2	6	189467	189472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659923
4594	NC_009525	AGCC	2	8	189507	189514	25 %	0 %	25 %	50 %	148659923
4595	NC_009525	GGT	2	6	189538	189543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659923
4596	NC_009525	ACG	3	9	189604	189612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659923
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4599	NC_009525	CCA	2	6	189708	189713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659923
4600	NC_009525	GTT	2	6	189741	189746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659923
4601	NC_009525	GCC	2	6	189822	189827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659923
4602	NC_009525	CAT	2	6	189828	189833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659923
4603	NC_009525	CGG	2	6	189893	189898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659923
4604	NC_009525	AGC	2	6	189909	189914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659923
4605	NC_009525	GGC	2	6	189942	189947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659923
4606	NC_009525	CGG	2	6	189950	189955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659923
4607	NC_009525	CAGC	2	8	189956	189963	25 %	0 %	25 %	50 %	148659923
4608	NC_009525	CGC	2	6	189987	189992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659923
4609	NC_009525	CG	4	8	190019	190026	0 %	0 %	50 %	50 %	148659923
4610	NC_009525	CGA	2	6	190053	190058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659923
4611	NC_009525	CGG	2	6	190067	190072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659923
4612	NC_009525	CAG	2	6	190080	190085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659923
4613	NC_009525	CGT	2	6	190158	190163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659923
4614	NC_009525	GC	3	6	190239	190244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_009525	CCG	2	6	190245	190250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_009525	TCA	2	6	190344	190349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659924
4617	NC_009525	TGGC	2	8	190369	190376	0 %	25 %	50 %	25 %	148659924
4618	NC_009525	CAAT	2	8	190446	190453	50 %	25 %	0 %	25 %	148659924
4619	NC_009525	CCGG	2	8	190556	190563	0 %	0 %	50 %	50 %	148659924
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4864	NC_009525	TGA	2	6	201319	201324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659934
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4866	NC_009525	ATCG	2	8	201501	201508	25 %	25 %	25 %	25 %	148659934
4867	NC_009525	CTG	2	6	201615	201620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659934
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4974	NC_009525	GACCT	2	10	206412	206421	20 %	20 %	20 %	40 %	148659937
4975	NC_009525	GC	3	6	206474	206479	0 %	0 %	50 %	50 %	148659937
4976	NC_009525	AC	3	6	206533	206538	50 %	0 %	0 %	50 %	148659937
4977	NC_009525	GGC	2	6	206559	206564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659937
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4981	NC_009525	TCC	2	6	206954	206959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659938
4982	NC_009525	TGC	2	6	207060	207065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659938
4983	NC_009525	CGA	2	6	207067	207072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659938
4984	NC_009525	GGTG	2	8	207085	207092	0 %	25 %	75 %	0 %	148659938
4985	NC_009525	TCG	2	6	207138	207143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659938
4986	NC_009525	CAT	2	6	207178	207183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659938
4987	NC_009525	GC	3	6	207245	207250	0 %	0 %	50 %	50 %	148659938
4988	NC_009525	GGC	2	6	207316	207321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659938
4989	NC_009525	CCG	2	6	207327	207332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659938
4990	NC_009525	TTG	2	6	207443	207448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659938
4991	NC_009525	TCC	2	6	207453	207458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659938
4992	NC_009525	TGC	2	6	207505	207510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659938
4993	NC_009525	CCG	3	9	207542	207550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659938
4994	NC_009525	TTC	2	6	207564	207569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659938
4995	NC_009525	G	6	6	207666	207671	0 %	0 %	100 %	0 %	148659938
4996	NC_009525	GCG	2	6	207710	207715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659938
4997	NC_009525	GC	3	6	207815	207820	0 %	0 %	50 %	50 %	148659938
4998	NC_009525	CCG	2	6	207891	207896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659938
4999	NC_009525	CCG	2	6	207917	207922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659938
5000	NC_009525	GCA	2	6	207973	207978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659938

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